Musaigen No Phantom World

Phantom adalah makhluk supranatural seperti hantu atau roh halus, yang sampai sekarang masih dianggap sebagai mitos.

Suatu ketika, sebuah virus yang menginfeksi otak tersebar meluas keseluruh dunia, dan membuat pandangan mereka berubah tentang phantom yang awalnya hanya dianggap sebagai mitos tetapi ternyata mereka selama ini hidup berdampingan dengan manusia. Virus ini juga dapat diturunkan turun temurun ,sehingga mereka dapat mengembangkan kemampuan untuk melawan hantu atau roh halus yang berniat jahat.

Haruhiko Ichijo, adalah siswa tahun pertama di Hosea Academy bersama dengan upperclassman nya Mai Kawakami, hantu yang berjuang dengan kemampuan "Roh Lima Elemen", Izumi Reina, yang memiliki kemampuan "phantom Eater", dan Koito Minase, yang berjuang melawan phantom sendirian. Mereka mengalami pasang surut dalam kehidupan sekolah, sebelum kejadian tertentu membuat mereka mengetahui kebenaran dari dunia ini.